馬來西亞近年來以砂拉越州(Sarawak)為主要疫區，其他州多為零星病例。2025年一月砂拉越州沐膠報告1例病例，當局已採取疫苗接種措施。全年均有風險，而砂拉越州之疫情高峰期為10月至12月。

防蚊策略如：
穿著淺色長袖衣褲、使用防蚊藥劑、使用蚊帳、避免於黎明和黃昏等病媒蚊活動高峰期，於豬(畜)舍及農田附近活動。若旅行時間大於一個月、戶外活動行程多、至鄉村、農業區、畜牧區旅遊，則建議施打疫苗。

近年來東南亞國家，皆有屈公病疫情發生，2025年截至5月有310例屈公病。屈公病目前沒有疫苗，主要的預防方式為預防蚊蟲叮咬(穿著淺色長袖衣褲、使用防蚊藥劑、使用蚊帳)。有慢性病及懷孕晚期的婦女，有較高風險產生嚴重疾病，於疾病流行期應避免前往。請注意相關警訊症狀，包括發燒、噁心嘔吐、頭痛、肌肉痛、關節痛(特別是手腳的小關節、手腕和腳踝)及出疹，若有以上不適，請及早就醫並告知醫師相關旅遊史。

馬來西亞為登革熱第一級旅遊警示國家，2025年初至年中登革熱病例相比2024年大幅下降，截至2025年7月初共通報32,299例，較去年同期的78,068例下降了58.6%。

目前國內尚無核准的登革熱疫苗，提醒旅客務必做好防蚊措施，如：穿著淺色長袖衣褲、使用防蚊藥劑、使用蚊帳，可避免病媒蚊叮咬，降低感染風險。
注意警訊症狀，如發燒、噁心嘔吐、頭痛、後眼窩痛、肌肉痛、關節痛及出疹，若有不適，請及早就醫。

馬來西亞為茲卡病毒感染症第一級旅遊警示國家。
目前無疫苗可預防，提醒旅客遵守當地的一般預防措施。該疾病可由病媒蚊、輸血、性行為傳染，通常不至於造成重症或住院個案，但懷孕期間感染茲卡病毒可能導致胎兒小頭畸形或死亡；孕婦及計劃懷孕婦女如要前往請先諮詢醫師，並於當地務必全程做好防蚊措施。懷孕婦女如從流行地區返國，2週內出現疑似症狀，應儘速就醫並告知醫師相關暴露史，醫師將進行採檢送驗及胎兒超音波檢查。

注意警訊症狀，如發燒、頭痛、後眼窩痛、紅疹、肌肉關節痛、非化膿性結膜炎，若有不適請及早就醫。

市區、都市近郊及沿海地區無感染風險，感染風險侷限在沙巴內陸地區、沙勞越內陸地區及馬來半島中部地區。建議前往前述風險區旅客採取防蚊措施，並請醫師評估是否需口服預防藥物。另當地瘧原蟲對氯奎寧(chloroquine)有抗藥性，請選擇其他合適之瘧疾預防藥物。請注意相關警訊症狀，包括發燒、噁心嘔吐、頭痛、肌肉痛、關節痛，返國後1年內，如果出現疑似瘧疾症狀，應立刻就醫，並告知醫師曾到瘧疾流地區。

馬來西亞為麻疹第一級旅遊警示國家，2024全年疫情較以往嚴峻。

1. 預防麻疹與德國麻疹最有效的方式為接種MMR疫苗，目前國內提供滿1歲及滿5歲的幼兒各一劑公費MMR疫苗；15歲到49歲的育齡婦女若經檢測為德國麻疹抗體陰性，可檢具德國麻疹抗體陰性報告，至各縣市衛生所或預防接種合約院所接種一劑公費MMR疫苗；其他民眾如為1966年(含)以後出生之成人且計劃前往流行地區，建議先洽旅遊醫學門診或國內提供自費MMR疫苗之醫療院所，評估接種一劑MMR疫苗。
2. 孕婦及未滿1歲的嬰幼兒是感染高危險群，應避免前往流行地區；如必須前往，6個月以上未滿1歲的嬰幼兒可於出發2週以前自費接種一劑MMR疫苗。
3. 孕婦不可接種MMR疫苗，如須前往流行地區，出發前請先與醫師諮詢確認有無德國麻疹抗體及是否適合前往，在當地務必戴口罩、勤洗手，以降低感染風險。

警訊症狀：

1. 前驅症狀-發燒、鼻炎、結膜炎、咳嗽和在發燒3-4天後口腔下臼齒對面內頰側黏膜上出現柯氏斑點（Koplik spots）。
2. 紅疹-柯氏斑點出現24-48小時後斑丘疹出現於耳後，再由臉擴散至軀幹四肢。

高風險之旅客可於行前諮詢醫師，決定是否使用自費暴露愛滋病毒前預防性投藥(PrEP)。

預防愛滋最重要的仍是做好安全性行為及相關防護措施，如不參加轟趴、性派對或有多重性伴侶、不共用針具、不使用毒品、定期篩檢等，以降低感染風險。

馬來西亞砂拉越州2024年12月中旬單週新增2例病例；2025年3月新增1例病例，經犬貓咬傷，當局呼籲民眾保持警覺，除確保家中寵物接種疫苗外，倘經犬貓抓咬傷，應立即就醫。

高感染風險之旅客，行前建議請醫師評估是否需要接種暴露前疫苗：

1. 頻繁接觸動物、從事動物相關工作的旅客(如獸醫、動物研究人員)。
2. 行程中無法避免遭動物抓咬(如露營、自行車旅遊、洞窟探勘等)。
3. 將前往當地偏僻、無法立即就醫地區的旅客。
4. 幼兒較容易受動物攻擊，若長期停留可考慮先接種疫苗。

暴露前預防接種需施打3劑疫苗，3劑之間需間隔至少21天，建議旅客至少提早1個月至旅醫門診諮詢。

注意警訊症狀，包括初期症狀非特異性(如感冒症狀、頭痛等)，抓咬傷部位異樣感，之後陸續出現吞嚥困難以致於引起恐水之現象（故又稱恐水症）、精神錯亂及抽搐等現象。如果不採取任何醫療措施，患者常在2~6天內因呼吸麻痺而死亡。

當地有感染血吸蟲的風險，請注意：

1. 避免接觸河流、湖泊、池塘等淡水水域。
2. 使用河水、湖水洗澡或洗衣，建議添加氯錠消毒，或在乾淨容器至少儲放2天再使用。
3. 如不慎碰觸淡水，請立即用酒精和乾毛巾大力擦拭皮膚，減低感染風險。

2025年馬來西亞疫情上升，5月下旬每日新增300例病例，較去年12月高峰為高，住院數亦上升，陽性率達68%，以NB.1.8.1為主要流行變異株。

嚴重特殊傳染性肺炎(COVID-19)為新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)，一種冠狀病毒(CoV)所引起的疾病。世界衛生組織將新型冠狀病毒所致的疾病正式命名為COVID-19 (coronavirus disease 2019)。

大部分的人類冠狀病毒以直接接觸帶有病毒的分泌物或飛沫傳染為主。有部分動物的冠狀病毒會讓動物出現腹瀉症狀，可以在糞便當中找到病毒，可能藉此造成病毒傳播，建議的預防措施與流感相同，包括接種疫苗、勤洗手、妥善處理口鼻分泌物等等。

於2022年馬來西亞的疫苗覆蓋率已接近8成左右，大馬政府更是在2022年8月宣布不論接種疫苗與否，入境馬來西亞後不需隔離。不過入境前後還是會有體溫掃描檢測，若有發燒或疑似症狀依然會被轉介至衛生單位進行複驗。雖2023年12月10日至16日中午12時，馬國再增加逾2萬696宗新冠確診病例，較上週(12月3日至9日)增加約60%，並新增28宗死亡病例。雖2023年底新冠疫情升溫及確診病例銳增，但馬國無意再次落實「行動管制令」（MCO）。

馬來西亞四季如夏，屬熱帶海洋性氣候，平地年均溫介於25-31℃，內地山區則介於22-28℃間。年平均雨量高，相對濕度平均高達80至85%。

熱疾病的預防：

1. 避開最熱的午間時段(上午11時到下午3時)、穿著適當服裝和防曬、補充水份及電解質。
2. 一般日常防曬建議SPF 15以上的產品，日間戶外活動則建議SPF 30以上的產品。